農業(yè)微生物是土壤健康的“守護者”和作物增產的“發(fā)動機”。但在科研中,如何從復雜的土壤或植物樣本中精準分離目標菌株?如何驗證其功能?
微基生物專注農業(yè)微生物分離培養(yǎng)-菌株鑒定-功能驗證-組學解析全鏈條技術服務,覆蓋土壤、植物、堆肥等全類型樣本。高效分離獲得純培養(yǎng)功能菌株,助力科研院所與高??焖佾@得優(yōu)質菌株資源,支撐高分文章發(fā)表與菌劑產品開發(fā)。
土壤微生物的使用研究與應用過程
一、微基生物提供廣篩型(探索未知)、靶向型(定向挖掘)分離培養(yǎng)服務

微基生物提供微生物需氧/厭氧活菌保存液,保障樣本運輸與菌株保存活性。
二、常見功能菌株類型
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功能菌株 |
代表菌株 |
典型功能 |
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植物促生菌(PGPR) |
內生菌、枯草芽孢桿菌 |
產IAA、鐵載體、ACC脫氨酶(抗逆) |
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養(yǎng)分轉化菌 |
根瘤菌、假單胞菌 |
固氮、解磷、解鉀、纖維素降解 |
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生物防治菌 |
鏈霉菌、貝萊斯芽孢桿菌 |
抗病毒、抗線蟲、誘導系統(tǒng)抗性 |
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脅迫緩解菌 |
芽孢桿菌、不動桿菌 |
重金屬固定、胞外多糖分泌、耐鹽堿 |
三、文獻分享 冬小麥根際促生細菌篩選
標題:Study on the isolation of rhizosphere bacteria and the mechanism of growth promotion in winter wheat in response to drought stress
期刊:Frontiers in Plant Science(2025年8月)
DOI:10.3389/fpls.2025.1595554
核心亮點:從冬小麥根際分離7株促生細菌,系統(tǒng)評價固氮、解磷、產IAA、ACC脫氨酶、鐵載體等功能;通過盆栽試驗驗證3株高效菌株對小麥抗旱與生長的促進效應;結合全基因組測序與比較基因組分析,首次揭示海藻糖合成、滲透調節(jié)、磷轉運等基因簇介導的抗旱促生機制,為小麥抗旱生物菌劑開發(fā)提供優(yōu)質菌種與理論支撐。
1.樣本類型:冬小麥根際土壤(根際細菌分離);冬小麥根組織(分離內生菌)。
2.細菌分離培養(yǎng)流程
冬小麥根內生細菌分離:根組織無菌水沖洗5min→70%酒精30s→1/100(v/v)次氯酸鈉處理3min→無菌水沖洗5次,LB平板驗證無菌落;消毒后根組織于無菌水培養(yǎng)皿過夜,復蘇內生菌。取1mL根組織研磨懸液加入99mL無菌水/PBS,30℃、160rpm振蕩2h,梯度稀釋至10-8。選取10-6、10-7、10-8梯度,各取100μL涂布TSA平板,連續(xù)培養(yǎng)2周,標記單菌落。
根際細菌分離:根際土壤經梯度稀釋后,采用稀釋涂布平板法在TSA培養(yǎng)基上分離純化,獲得單菌落菌株。
3.功能驗證技術方法

1)促生功能體外測定:固氮、解磷、鐵載體、IAA、ACC脫氨酶的體外測定。
2)盆栽抗旱試驗:設置正常與干旱脅迫組,測定株高、根長等生長指標。
3)基因組與功能基因分析:全基因組測序+比較基因組分析,定位關鍵基因簇。
4)菌株耐旱性測定:PEG6000模擬干旱(5%~30%),測定OD600評價生長情況。
三、結果與圖表解讀
1. 菌株分離與鑒定:7 株放線菌門功能菌成功篩選
基于16S rRNA基因的菌株系統(tǒng)發(fā)育樹
基于16S rRNA基因測序構建系統(tǒng)發(fā)育樹,成功分離7株根際細菌,均屬于放線菌門:Microbacterium、Arthrobacter、Paenarthrobacter等屬。
2. 促生功能驗證:3 株菌具備全能促生特性
表1 7株細菌的促生功能指標
4株菌具有解磷能力,T19解磷量最高(51.81mg/L);I2、R4、K2同時具備固氮、解磷、產IAA、鐵載體、ACC脫氨酶五大功能;I2鐵載體活性最高(37.32%),R4 ACC脫氨酶活性最強。
3. 干旱脅迫下促生效果:K2菌株抗旱潛力突出
不同菌株對小麥株高與根長的影響
正常條件下I2、R4、K2使小麥株高分別提升5.17%、13.02%、12.14%;干旱條件下僅K2顯著促進根系生長,根長提升11.94%,抗旱優(yōu)勢突出。
4. 基因組解析:功能基因簇揭示促生抗旱機制
3株高效菌株KEGG功能注釋
I2、R4、K2 菌株基因組圈圖
對I2、R4、K2進行全基因組測序與KEGG注釋:3株菌基因組均富集碳水化合物代謝、氨基酸代謝、次生代謝產物合成核心通路,具備完整的環(huán)境適應與促生遺傳基礎;菌株含解磷(pstABCS)、固氮(nifUHJ)、ACC 脫氨酶(accABD)、海藻糖合成(treXYZ/ostAB)等功能基因簇,其中K2獨有多重海藻糖合成通路,是其抗旱能力突出的核心原因。
本研究建立分離→功能篩選→盆栽驗證→基因組解析”完整體系,篩選出的高效抗旱促生菌株,為小麥生物菌劑開發(fā)提供優(yōu)質菌種與理論支撐。
農業(yè)微生物研究旨在通過分離、培養(yǎng)并篩選具有促進農作物增產、防治病害和調節(jié)土壤肥力等優(yōu)良功效的微生物菌株,微基生物以專業(yè)的技術及多年經驗累積為農業(yè)微生物菌株的研究提供更高效的解決方案,助力科研實驗。
參考文獻
1. Luo C H, He Y J, Chen Y P. Rhizosphere microbiome regulation: Unlocking the potential for plant growth[J]. Curr Res Microb Sci, 2024, 8:100322.
2. Zhang L J, Pan Y S, Qi Y J, et al. Study on the isolation of rhizosphere bacteria and the mechanism of growth promotion in winter wheat in response to drought stress[J]. Front Plant Sci, 2025, 16:1595554.

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